在海军陆战队登陆成功之后，并沒有急于向巴达维亚城发动进攻，因为进攻巴达维亚城，是陆军的任务，而海军陆战队也缺少重型爆破武器，冒然攻城，必然损失严重。因此中华军的海军陆战队向巴达维亚的港口发动进攻，同时中华军的战舰也从海上逼近了港口。
逃回港口的荷军战舰还惊魂未定，但马上就发现，原来自己已经被中华军从海陆两路堵在港口里了，这一下可就真的成了瓮中之鳖。虽然荷兰战舰上都装配有火炮，但一来是荷兰各战舰的弹药都严重不足，二来现在大势己去，陆基被中华军占领，港口被封锁住，就算是弹药充足，也不可能扭转战局。而就在这时，不知是那一艘荷兰战舰首先打出了白旗，举手投降，随后其他的荷兰战舰上也都纷纷效枋，都打出了白旗，全部投降因此中华军也没有经过战斗，就占领了港口，而停泊在港口里的二十二艘荷兰战舰，十艘荷兰商船，也都成为中华军的战利品。
这时在陆地上，中华军也己经深入到巴达维亚城里，并控制住了大部份的地区，荷兰士兵和土著士兵节节败退，不是被打死，就是向中华军投降。现在荷兰军队在整个巴达维亚城里，只控制着以议会大厅为中心加上周边的小部份地区。而守兵也只剩下五六百人。
而这时荷兰东印度公司的董事们也都聚集在议会大厅里，有人急得像热锅上的蚂蚁，团团乱转；有人脸色苍白、目光呆滞；有人喃喃自语，但嘴唇直打哆索，还有人拼命的往嘴里灌着酒，而马特索科尔坐在主席的位置上，面如死灰，眼光空洞无神，显然是一付听天由命的样孑。总之是千奇百怪，形像各异。
因为现在的局面已经十分清楚了，巴达维亚已经失守，荷兰东印度公司也彻底失败了。现在所有的董事面临的问题，是选择轰轰烈烈的战死，还是马上投降，苟且偷生。但留给董事们的时间也不多，中华军己经打到了议政大厅，枪炮爆炸的声音己经听得十分清楚，不容他们再磨叽了。
就在这时，终于有一名董事受不了，站了起来，大声道：“投降吧，投降吧，我可不想死了，以后的事情怎么样，等以后再说吧，现在我还不想死啊。”
其实绝大部份董事都有投降的想法，只是这个弯一下转不过来，因为要投降的话，当初就有的是机会，不仅可以保住命，还能保住公司和一部份财产，但却都被董事们放弃了，而现在投降，则是一无所有，连命保不保得住，都还二说，因此也让不少董事们心里都生出早知今曰，何必当初的想法来。但有了一个领头的，也为其他人打开了一个心理上的缺口，因此其他董事也都纷纷表示向中华年投降吧，反正好死不如赖活着。
因此没过多久，在巴达维亚的议政大厅上就打出了一面白旗，中华军见了，也停止了进攻，过了一会儿，只见从议政大厅里走出来几个人，没带武器，高举双手向中华军连络请降。在得到了军长田楚的保证所有人员生命安全的承诺之后，荷兰东印度公司的董事们也都全部走出了议政大厅，接受中华军的控制，将随后中华军派出一支军队，进驻议政大厅，将彻底占领了巴达维亚城。
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